“东京决战”一年后，布里塔尼亚少年鲁路修在11区（原日本国）过着平凡的学生生活。但是，鲁路修与弟弟罗洛的一次出行，遇到了黑色骑士团的余党。在与少女C.C再次结成契约之后，尘封的记忆摆在了鲁路修的面前。
自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的
在平稳而乏味的乡村生活的少年·近卫刀太，有着前往都市一展宏图的梦想。为此，他每天都向养育了自己的亲人，同时也是优秀的魔法使·雪姬发起挑战。但，一边战斗一边和睦度日的两人面前出现的赏金猎人，宣告了平稳乡
死神武器职业专门学校，简称“死武专”。其学生分为“工匠”与“武器”。据称，收集99个鬼神的灵魂与1个魔女的灵魂，“武器”就会进化成最强的死神武器“DEATHSCYTHE”以最强的“工匠”为目标的镰刀“
结城梨斗（渡边明乃配音）正派开朗，细心友善。一直以来，梨斗都暗恋着青梅竹马西连寺春菜（矢作纱友里配音），可是，对于恋爱一窍不通的梨斗只是将这份强烈的感情深深的埋藏在心底。终于，梨斗再也无法压抑心中对于
新学期刚开始，高中生·坂井悠二一如往常过着“日常生活”。然而有一天，他冷不防遭遇红世之王手下的侵袭。受到一名能够把人的存在化为灵火，并吸取灵火的神秘男子法利亚格尼的攻击。悠二的“日常”生活因此整个脱节
在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身
町子凉（佐藤利奈配音）的父母都在海外工作，相依为命的奶奶又不幸去世，小小年纪的凉不得不开始了独自一人的生活。没过多久，凉就发现，自己做饭的手艺竟然大不如从前，这让向奶奶保证勤练厨艺的她感到十分内疚。一
